A Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amapá – FAPEAP, criada pela Lei, 1.438 de 30 de dezembro de 2009, vinculada à Secretaria de Estado da Ciência e Tecnologia – SETEC, é uma Fundação de direito público, com autonomia administrativa e financeira, sede e foro na Capital do Estado e jurisdição em todo o território amapaense. A Fundação de Amparo à Pesquisa do Amapá é filiada ao Conselho Nacional das Fundações de Amparo à Pesquisa (CONFAP), sendo este localizado em Brasília.